Le programme des aides maritimes à la navigation a pour mandat en vertu de de différents textes de loi, sans pour autant y être tenue, de fournir des aides à la navigation dans la région du Centre et de l'Arctique, de façon à faciliter la circulation sûre et rapide des navires.

Sur le plan géographique, la région du Centre et de l'Arctique s'étend sur près des deux tiers du territoire canadien. Elle comprend l'Ontario, le Manitoba, la Saskatchewan, l'Alberta, le Nunavut et les Territoires du Nord-Ouest.
Comme dans le cas du bureau régional de Sarnia, l'entretien des aides à la navigation de la région du Centre et de l'Arctique est assuré par les bases de la Garde côtière établies à Prescott, Parry Sound et Hay River, ainsi que par les bases secondaires de Amherstberg, Thunder Bay, Kenora et Selkirk.
À partir de ces bases, on voit à l'entretien d'environ 7100 aides à la navigation fixes et flottantes à courte portée, telles que des bouées, des alignements, des balises radar (RACON) et des phares, utilisées par la marine marchande, les bateaux affrétés et les plaisanciers.